癌症从本质上讲是一种异质性疾病，其内部存在不同表型及遗传差异的细胞亚群（subclone）。肿瘤的异质性不仅指不同个体间的差异，更重要的是指同一个体内，单个肿瘤内部不同细胞的以及原位肿瘤和转移肿瘤之间的异质性。肿瘤细胞的异质性是肿瘤细胞进化的基础，也是其难以治疗的重要原因，理解其遗传机制就有重要的临床应用价值。我们之前在《Nature Genetics》上的研究已揭示出胰腺癌单个肿瘤内不同区域的高度异质性，内部不同的细胞亚群进化出不同的远程转移肿瘤（distant metastasis）。为进一步研究肿瘤细胞进化的机制，我们计划利用单细胞测序技术对同一个体内的原位肿瘤和多个转移肿瘤进行多层次的组学分析研究，包括单细胞基因组分析（scDNA-seq），表达分析（scRNA-seq），甲基化分析（scBS-seq）以及染色质分析（scATAC-seq），进而研究肿瘤细胞基因组序列的异质性与表观基因组异质性之间的关系。本人所在的实验室有成熟的scDNA-seq，scRNA-seq及scATAC-seq的实验技术和生物信息分析手段，用细胞系所做的前期预实验已取得了初步的结果。
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